Center for Computing in Engineering & Sciences (CCES) (2013-2019)

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2019

1.   2019-Atual. Arapuan - Interoperability of agricultural data in eScience
Descrição: eScience research is increasingly involved in handling large heterogeneous data that span wide ranges in space and time scales. It requires collaboration among researchers from multiple disciplines - each with their own orientations towards problem identification, solution formulation and implementation. Thus, there is a widespread consensus that scientific discovery is increasingly data-driven. Scientists use a plethora of computational tools and environments in exploring data and processes (transforming, analyzing, correlating and visualizing them). There are several Computer Science research challenges to be faced in this context: from providing friendly collaborative environments (and thus interfaces, computational infrastructure, open repositories) to allowing "de facto" interoperability across data and processes. This project concentrates on this last issue, more specifically for applications in the agro-environmental domain. Its goal is to develop research to help diminish interoperability gaps, involving data and processes concerning multi-scale data in space and time that are collected, generated and shared by scientists in transdisciplinary research. Scale, in the context of this project, refers to temporal and/or geographic granularity, both of which varying according to the observed phenomena. We will consider multi-scale interoperability from two different points of view: for interoperable data management, we will concentrate on semantic solutions (e.g., use of ontologies); for interoperability of processes, and to support transdisciplinary collaboration the idea is to explore scientific workflows. The main result will be the specification and prototypical development of a computational infrastructure (composed by repositories for data and processes, and software tools) to help access and navigation through multi-scale data and processes, offering scientists many modes of querying and navigation. The research will be conducted together with domain scientists who work in agro-environmental applications. The proponents have a history of joint projects and collaboration in these fields, with researchers from computer science and agro-environmental issues. The project involves collaboration with three international groups (at Universite Paris Dauphine, France; at the University of Copenhagen, Denmark, and at LBNL, USA), and with an emergent group at a new Brazilian Federal Institute, which will moreover help enhance the research being developed at that institute. The project's name -- Arapuan (Beehive in tupi-guarani) -- reflects its nature, in the sense that it involves a group of researchers who, cooperatively, will strive to propose solutions to multifaceted problems (like bees in a hive).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . Integrantes: Claudia Maria Bauzer Medeiros - Coordenador / Marco Antonio Vaz Salles - Integrante / Gilberto Zonta Pastorello Jr - Integrante / Eliane Martins - Integrante / Rubens Augusto Camargo Lamparelli - Integrante / André Santanchè - Integrante / Carla Geovana do Nascimento Macario - Integrante / Daniel Cintra Cugler - Integrante / Khalid Belhajjame - Integrante / Julio Cesar dos Reis - Integrante. Financiador(es): (CNPq) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Cooperação.
Membro: Claudia Maria Bauzer Medeiros.

2018

1.   2018-Atual. Algoritmos e Metodos para a Separacao de Difracoes no Dominio Pre-Empilhado e Extracao de Parametros Anisotropicos em Sistemas de HPC
Descrição: O presente projeto tem como principais objetivos a pesquisa, desenvolvimento e aplicação prática de técnicas de separação e regularização 5D de difrações no domínio pré-empilhado, assim como extração de parâmetros cinemáticos relacionados a parâmetros anisotrópicos do meio. As técnicas serão desenvolvidas para sistemas de computação de alto desempenho e os resultados obtidos, em particular softwares de aplicação direta em produção, terão impacto significativo na validação de modelos de velocidade para migração em geologias complexas como as existentes nos reservatórios da camada pré-sal.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: Edson Borin - Integrante / Caian Benedicto - Integrante / João Sacramento - Integrante / Jorge Faccipieri - Integrante / Martin Tygel - Coordenador / Tiago Antonio Alves Coimbra - Integrante / Danny Rueda - Integrante / Alcides Goldoni Junior - Integrante / Nicholas Torres Okita - Integrante / Lucas M. Araújo - Integrante. Financiador(es): Petróleo Brasileiro - Cooperação.
Membro: Edson Borin.
Descrição: O presente projeto tem como principais objetivos a pesquisa, desenvolvimento e aplicação prática de uma técnica de separação e regularização 5D de difrações no domínio pré-empilhado, assim como extração de parâmetros cinemáticos relacionados a parâmetros anisotrópicos do meio. Os resultados obtidos, em particular softwares de aplicação direta em produção, terão impacto significativo na validação de modelos de velocidade para migração em geologias complexas como as existentes nos reservatórios da camada pré-sal.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Martin Tygel - Coordenador / F. Gamboa - Integrante / Faccipieri, J.H. - Integrante / COIMBRA, T.A. - Integrante / Caian Benedicto - Integrante / Edson Borin - Integrante / Alcides Goldoni Junior - Integrante / Dany Rueda Serrano - Integrante. Financiador(es): Petróleo Brasileiro - Rio de Janeiro - Matriz - Auxílio financeiro.
Membro: Martin Tygel.
2.   2018-Atual. Aprimoramentos para Sistemas de Memoria de Computadores
Descrição: Sistemas de Memória de computadores são reconhecido como fonte de grandes latências e baixa banda de transferência quando comparados com os processadores. A solução convencional de ampliar a hierarquia de memória e armazenar cópias dos da- dos, tirando proveito das localidades temporais e espaciais, não tem sido suficiente para reduzir ou minimizar a diferença de desempenho entre os níveis da hierarquia e os elementos de processamento. Neste projeto, pretendemos atacar este problema de duas vertentes distintas: (1) Pretendemos utilizar Near Data Processing (NDP) para encontrar e desenvolver técnicas de processamento próximas dos elementos de armazenamento de dados; e (2) Pretendemos encontrar novas formas de interconexão tirando proveito de sistemas desagregados, com foco especial em interconexão ótica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rodolfo Jardim de Azevedo - Coordenador / Sandro Rigo - Integrante / Lucas Wanner - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Rodolfo Jardim de Azevedo.
3.   2018-Atual. Construcao de um atlas genomico para termotolerancia em Saccharomyces cerevisiae visando processos 1G e 2G
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Leandro Vieira dos Santos - Integrante / Bruna Zavati Zavitoski - Integrante. Financiador(es): Universidade Estadual de Campinas - Auxílio financeiro.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
4.   2018-Atual. Determinacao de estruturas de proteinas usando restricoes de distancia obtidas de experimentos de ligacao cruzada: metodos computacionais e aplicacoes
Descrição: Métodos de modelagem molecular fazem parte das estratégias para a determinação de estruturas de proteínas, independentemente do uso de dados experimentais. A modelagem possui um papel maior ou menor na determinação das estruturas, em função da resolução dos dados experimentais. Quando os experimentos provém informação estrutural muito precisa, os métodos de modelagem são usados apenas para o ajuste de conformacional de pequenos fragmentos da estrutura. Isto é o que acontece com frequência na determinação de estruturas por cristalografia de raios-X. Por outro lado, quando a informação estrutural possui resolução menor, a modelagem assume um papel central. Métodos de modelagem são ferramentas intrínsecas da determinação de estruturas por RMN, criomicroscopia eletrônica, ou a partir de dados ainda menos precisos, como de espalhamento de raios-X a baixo ângulo e dicroísmo circular. Mais recentemente, experimentos de ligação cruzada analisados por espectrometria de massas têm sido desenvolvidos para a obtenção de restrições distância que podem ser, em princípio, usadas para auxiliar a determinação de estruturas tridimensionais. Estes dados têm sido úteis na determinação da posição relativa de estruturas em complexos proteicos, mas seu uso na determinação de estruturas terciárias ainda não é bem sucedido. Neste projeto, propomos o desenvolvimento de uma série de metodologias computacionais que visam responder às limitações da informação obtida por ligação cruzada/espectrometria de massas para a determinação de estruturas terciárias de proteínas. Protocolos de modelagem, campos de força, e métodos estatísticos de classificação e análise de dados são propostos, levando em consideração a natureza estrutural e a resolução específica destas restrições.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Leandro Martínez - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro.
Membro: Leandro Martinez.
5.   2018-Atual. High-Performance Geophysics lab computing infrastructure upgrade
Descrição: In this project we are upgrading the high-performance computing infrastructure installed at the High-Performance Geophysics lab to expand the laboratory?s processing capacity. This upgrade includes a new high-performance computing system that will be able to perform up to 350 TeraFlops. This new system will be used to support the HPG research on new seismic processing technologies for 3D seismic datasets.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Edson Borin - Coordenador / Martin Tygel - Integrante. Financiador(es): Petróleo Brasileiro - Cooperação.
Membro: Edson Borin.
6.   2018-Atual. Managing the Effects of Linked Data Evolution (FAPESP SPRINT / Swinburne University of Technology)
Descrição: The Linked Data model has shown the way towards publishing and interlinking data on the web by using Semantic Web Technologies. These technologies are based on the RDF model data which describes diverse types of resource in a structured way and provide links between distinct resources. The evolving RDF data model creates data synchronization and link maintenance issues. This research project aims to investigate new methods and algorithms capable of making corrections in connections between structured data (organized according to ontologies) based on the evolution of ontological properties (changes).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Julio Cesar dos Reis - Coordenador / Rodrigo - Integrante / Timos Sellis - Integrante / Ahsan Morshed - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Julio Cesar dos Reis.
7.   2018-Atual. Modeling and Developing Actor Database Applications (International Network Programme - University of Copenhagen)
Descrição: Given the societal value and promise of emerging applications like Internet-of-Things (IoT) services, and computer games, among others, it is desirable to leverage software infrastructures such as actor database systems to increase developer productivity as well as application runtime efficiency and scalability. However, there is a dearth of work on modeling and supporting the development of actor database applications. The goal of this project is to jointly explore the new paradigm of actor database systems and investigate possible solutions to the gap in modeling and development support for actor database applications. Collaboration with University of Copenhagen -- Department of Computer Science (DIKU). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Julio Cesar dos Reis - Integrante / Marcos Antonio Vaz Salles - Coordenador / Yongluan Zhou - Integrante / Claudia Bauzer Medeiros - Integrante. Financiador(es): Danish Agency for Science and Higher Education - Auxílio financeiro.
Membro: Julio Cesar dos Reis.
8.   2018-Atual. Multi-Scale Dynamic Failure Modeling of Heterogeneous Materials
Descrição: In this project new numerical techniques are proposed for modeling 3D multi-scale dynamic failure problems in heterogeneous materials. Polycrystalline and composite materials 3D microstructures will be analyzed considering their heterogeneities and anisotropy of the elastic material properties. Dynamic displacement fields at the meso-scale will be evaluated in an atomistic and molecular scales to generate a cohesive law that will characterize the failure location and propagation. The direct homogenization method that is based on the volume average of field quantities of stresses and strains will be applied to evaluate the effective elastic properties of composite materials. Acceleration methods, as the Adaptive Cross Approximation (ACA), will be applied to accelerate the numerical solution in order to deal with the large number of degrees of freedom in composite structures. New techniques for generally anisotropic media will be implemented and tested for more accurate results.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Paulo Sollero - Coordenador / renato pavanello - Integrante / Andres A F Galvis - Integrante / Juan Esteban Alvarez Naranjo - Integrante / Lucas Santana Moura - Integrante. Financiador(es): Air Force Offce of Scientific Research - Auxílio financeiro.
Membro: Paulo Sollero.
9.   2018-Atual. Research and development of technologies for high performance seismic processing on the cloud
Descrição: In this project, we are investigating and developing new technologies to facilitate high-performance seismic processing using cloud computing services, including Software as a Service (SaaS), Platform as a Service (PaaS) and Infrastructure as a Service (IaaS). The resulting technologies will be consolidated on a platform that must optimize the cost and performance of seismic processing applications on the cloud, including loosely- and tightly-coupled high-performance seismic applications and machine learning based seismic applications.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (3) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Edson Borin - Coordenador / TYGEL, MARTIN - Integrante / Tiago Antonio Alves Coimbra - Integrante / Jorge Henrique Faccipieri Junior - Integrante / Jeferson Brunetta - Integrante / Charles Boulhosa Rodamilans - Integrante / Nicholas Torres Okita - Integrante / Lucas M. Araújo - Integrante / Eva Maia Malta - Integrante / Willian Hayashida - Integrante / Murilo Guidetti Andrietta - Integrante / Renan Clarindo Amorim - Integrante / José Ribeiro Neto - Integrante. Financiador(es): Petróleo Brasileiro - Cooperação.
Membro: Edson Borin.

2017

1.   2017-2018. Accelerating the CRS seismic processing method with GPUs
Descrição: Exploration geophysics is extensively applied by the oil industry to better understand the subsurface of the earth, thus rising the chances of finding reservoirs of fossil fuels and minerals. This is a branch of geophysics that aims to characterize the subsurface by conducting measurements at Earth?s surface (Land or Sea). During seismic data acquisition, a source generates waves that propagates through the water and reflects, diffracts and refracts into the subsurface layers. Some of the reflected waves returns to the surface and meets hydrophones, which record the data. Once recorded, the seismic data is later processed to improve the signal-to-noise ratio and to construct images that helps geologists to understand the meaningful features of the subsurface. The Common Reflection Surface (CRS) algorithm (Mann et al., 1999; Jäger et al., 2001) is a generalized version of one of the key algorithms used in exploration geophysics to improve the signal-to-noise ratio, the Common Midpoint (CMP) method (Mayne, 1962). The CRS method takes data collected in the field (after preprocessing) and generates a so called Zero-offset Stacked section, along with some properties of the subsurface structures, such as velocity, dip angles and curvatures. To accomplish this task, the method solves an optimization problem in which a coherence metric mult be computed for several combinations of parameters A, B and C, which requires a huge amount of computation. Moreover, this computation exposes a high degree of data locality, which makes it CPU bound. These properties are typically prerequisites for exploring the full potential of GPUs. Since drilling is a very expensive task, with prices around hundreds of millions of dollars, investing in exploration geophysics is important to reduce uncertainties, saving a lot of manpower and resources. The main objectives of this project are: a) Quantify the performance benefits when accelerating the CRS method with GPUs; and b) Understand the productivity and code performance trade-offs when using OpenACC and CUDA to accelerate seismic processing code.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Edson Borin - Coordenador / Martin Tygel - Integrante. Número de orientações: 1
Membro: Edson Borin.
2.   2017-Atual. Construcao de um atlas genomico para engenharia racional de Saccharomyces cerevisiae visando a producao de etanol de segunda-geracao.
Descrição: O projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um atlas para engenharia racional e direta de Saccharomyces cerevisiae, que possibilitará o desenvolvimento de linhagens de levedura customizadas para a produção de etanol 2G, sem a necessidade de passar pelo laborioso e randômico processo de evolução adaptativa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante / Eliane Laranja Dias - Integrante / Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / Leandro Vieira dos Santos - Coordenador / Sheila Tiemi Nagamatsu - Integrante / PIROLLA, RENAN AUGUSTO SIQUEIRA - Integrante / Jaciane Lutz Ienczak - Integrante / GABRIEL RIBEIRO BUENO, JOAO - Integrante / GOZZO, FÁBIO CESAR - Integrante / Sarita Cândido Rabelo - Integrante / Bruna Zavati Zavitoski - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / DOS SANTOS, LEANDRO VIEIRA - Coordenador.
Membro: Marcelo Falsarella Carazzolle.
3.   2017-Atual. ENGENHEIRAMENTO GENETICO DA CEPA INDUSTRIAL BRASILEIRA BARRA GRANDE PARA FERMENTACAO DE XILOSE
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Falsarella Carazzolle - Coordenador / Juliana Velasco - Integrante.
Membro: Marcelo Falsarella Carazzolle.
4.   2017-Atual. Estudo das alteracoes geneticas e metabolicas do Adenoma Pleomorfo e Carcinoma Ex-Adenoma Pleomorfo por exoma, expressao genica e imunohistoquimica
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Falsarella Carazzolle - Coordenador / Fernanda Viviane Mariano Brum Correa - Integrante.
Membro: Marcelo Falsarella Carazzolle.
5.   2017-2018. Estudo teorico de sondas fluorescentes para determinacao de cations metalicos.
Descrição: Estudo teórico de sondas fluorescentes para determinação de cátions metálicos. Processo No.: 2221/17. Natureza do projeto: Auxílio à pesquisa. Período: 04/04/2017 a 04/04/2018. Fonte financiadora: Fundo de Apoio ao Ensino, à Pesquisa e à Extensão (Pró-Reitoria de Pesquisa) (FAEPEX-PRP/UNICAMP).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Coordenador / Iran da Luz Sousa - Integrante. Financiador(es): Fundo de Apoio ao Ensino, à Pesquisa e à Extensão - Auxílio financeiro.
Membro: Nelson Henrique Morgon.
6.   2017-Atual. EvOLoD: Evolucao de Dados Interconectados na Web Semantica (Jovem Pesquisador FAPESP)
Descrição: A possibilidade de interconexão entre diferentes repositórios de dados estruturados pode alterar significativamente a maneira como conhecimento é produzido e consumido na Web. Para esse fim, ontologias visam representar a semântica em sistemas computacionais. . Na Web Semântica, ontologias apoiam a publicação e interconexão explícita de elemento de dados estruturados e definidos semanticamente a partir de diferentes fontes. Ontologias são referências para a geração de anotações semânticas que consistem em relações explícitas semanticamente denotadas a partir de um conceito da ontologia para um elemento textual de um documento Web. Isso permite a interpretação semântica de dados e das informações anotadas, e o consequente raciocínio lógico para suportar consultas sofisticadas. No entanto, a Web é dinâmica e os dados estruturados definidos tendem a evoluir através de novas versões de bases de conhecimento que são atualizadas regularmente. Esse cenário gera desafios complexos de investigação pois a definição das propriedades de conceitos e suas instâncias tendem a sofrer modificações (e.g., remoções, alterações de valores) e impactam potencialmente na qualidade de um volume enorme de anotações e interconexões existentes. Este projeto de pesquisa objetiva estudar a evolução de dados interconectados na Web Semântica. Visamos construir um framework que permite capturar e caracterizar as mudanças em repositórios de dados estruturados e implementar automaticamente adaptações sobre interconexões e anotações afetadas por essas mudanças. O framework explora tecnologias da Web Semântica como RDF(S) e linguagens de descrição de ontologias OWL. Além da formalização dos métodos, realizaremos validações experimentais para avaliar empiricamente e profundamente as soluções desenvolvidas em estudos de caso realísticos. As contribuições esperadas envolvem novos algoritmos e ferramentas de software implementando os métodos propostos em um arcabouço completo que pode aprimorar a consistência da evolução de dados interconectados descritos semanticamente.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) . Integrantes: Julio Cesar dos Reis - Coordenador / DA SILVEIRA, MARCOS - Integrante / BONACIN, RODRIGO - Integrante / BARANAUSKAS, M. CECILIA C. - Integrante / André Santanche - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Julio Cesar dos Reis.
7.   2017-Atual. Modeling and Developing Actor Database Applications
Descrição: Actor databases are a new trend in database research that combines the actor model with database system concepts and techniques. It is speculated that this combination of features in actor database systems can turn out to be particularly useful for modern data-driven applications demanding stateful computations along with interactive response times. Examples of these types of applications include location-sensitive mobile applications, Internet-of-Things (IoT) services, and computer games, among others. Given the societal value and promise of these emerging applications, it is desirable to leverage software infrastructures such as actor database systems to increase developer productivity as well as application runtime efficiency and scalability. However, there is a dearth of work on modeling and supporting the development of actor database applications. The goal of this project is to jointly explore the new paradigm of actor database systems and investigate possible solutions to the gap in modeling and development support for actor database applications This project has 2 coordinators - in Denmark, Marcos Antonio Vaz Salles; in Brazil, Claudia Bauzer Medeiros. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (4) . Integrantes: Claudia Maria Bauzer Medeiros - Coordenador / Marco Antonio Vaz Salles - Integrante / Julio Cesar dos Reis - Integrante / Yongluan Zhou - Integrante / Li Su - Integrante. Financiador(es): University of Copenhagen - Cooperação.
Membro: Claudia Maria Bauzer Medeiros.
8.   2017-Atual. Nuvem Computacional Cientifica da UNICAMP
Descrição: Pesquisador da Equipe Científica do Projeto: "Nuvem Computacional Científica da UNICAMP". Coordenador: Álvaro Penteado Crósta (Coordenador Geral da UNICAMP). Processo: MCTI/FINEP/CT-INFRA - PROINFRA - 02/2014 Natureza do projeto: Equipamentos Multiusuários. Período: 2017. Fonte financiadora: Financiadora de Estudos e Projetos (FINEP).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Integrante / Álvaro Penteado Crósta - Coordenador / Outros Pesquisadores da Unicamp - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
Membro: Nelson Henrique Morgon.
9.   2017-Atual. OpenDesign: tecnicas e artefatos para o design socialmente consciente de sistemas computacionais (FAPESP/MCTI/MC/CGI)
Descrição: Nos últimos anos, têm se tornado mais evidentes os impactos indesejados que sistemas computacionais têm desencadeado em questões econômicas, éticas, políticas, e na vida em sociedade. Argumentamos que tais problemas em geral decorrem de uma visão de desenvolvimento de software que não privilegia o mundo social no qual as soluções são utilizadas. Subscrevemos uma visão sistêmica para o design de sistemas interativos, que considere a solução técnica como parte de um sistema social mais complexo no qual as pessoas vivem e interagem, e no qual a sociedade desenvolve seus padrões de comportamento, valores, normas sociais, legais, etc. O desenvolvimento de software nas organizações tem sido guiado por métodos e processos desde os tradicionais e estruturados, até os mais recentemente populares métodos ágeis e enxutos (lean). Por outro lado, comunidades de desenvolvimento open source têm criado produtos de software de qualidade, fazendo-os emergir de sua prática. O fenômeno do desenvolvimento distribuído de código aberto tem atraído a atenção da comunidade de pesquisa para formas como as comunidades open source se articulam. Não é de nosso conhecimento o mesmo esforço comunitário no design do sistema interativo como um todo, isto é, nas atividades que precedem o desenvolvimento de código propriamente dito, iniciando pela clarificação do problema de design e proposição de soluções. É para esta frente que propomos este Projeto, que estamos denominando OpenDesign. Objetivamos caracteriza-lo, formalizar um processo de design e desenvolvimento nessa perspectiva, e desenvolver uma plataforma de apoio ao seu uso. Esperamos estender o estado da arte no tema e viabilizar a prática acadêmica e profissional no design 'aberto' de sistemas interativos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Julio Cesar dos Reis - Integrante / Rodrigo - Integrante / Roberto Pereira - Integrante / BARANAUSKAS, M. CECÍLIA C. - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Julio Cesar dos Reis.
10.   2017-Atual. Otimizacao Topologica de Sistemas Multifisicos e Multiescala.
Descrição: Projeto vinculado à programa de Bolsa de Produtividade em Pesquisa do CNPq sobre o tema: Otimização Topológica de Sistemas Multifísicos e Multiescala.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Renato Pavanello - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Renato Pavanello.
11.   2017-Atual. Sistemas socioenativos: investigando novas dimensoes no design da interacao mediada por tecnologias de informacao e comunicacao (Tematico FAPESP)
Descrição: A presença de novas tecnologias e de novas modalidades de interação (interfaces tangíveis, vestíveis e naturais), somada à ubiquidade da computação e das redes sociais, apresentam desafios que demandam a consideração de novos fatores (emocionais, físicos e culturais) no design de sistemas computacionais constituídos por processos humanos e tecnológicos, vinculados dinamicamente (sistemas sócio-enativos). Tais sistemas representam um cenário complexo para o qual ainda não se tem bases teóricas e metodológicas (e nem experiências práticas) adequadas para seu design. As maneiras como as pessoas irão interagir em ambientes sócio-enativos não é fácil de explicar e de predizer em tempo de design. Consequentemente, a essência de como desenvolver sistemas dessa natureza requer o tratamento de aspectos tecnológicos nos quais a consideração da dinâmica social é potencializada por conceitos como Acesso Universal e Participativo, Computação Afetiva, Ubíqua, Valores e Pragmática. Este projeto objetiva construir um framework conceitual a partir da experimentação com diferentes cenários, que instrumentalize aqueles envolvidos com o design e desenvolvimento de tais sistemas a produzirem soluções tecnológicas que efetivamente levem em conta o contexto cultural dos que dele participam, incluindo suas diferenças, necessidades, preferências, habilidades e valores. Este framework articulará o uso de novas tecnologias de interfaces tangíveis, vestíveis e naturais com o conceito de web pragmática para o design socialmente responsável em diferentes contextos. O conhecimento produzido com o projeto tem o potencial de influenciar o modo como sistemas interativos são entendidos e projetados. (AU). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Julio Cesar dos Reis - Integrante / BARANAUSKAS, M. C. C. - Coordenador / Rodrigo - Integrante / Roberto Pereira - Integrante / Heiko - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Julio Cesar dos Reis.
12.   2017-2018. XIX Simposio Brasileiro de Quimica Teorica - SBQT 2017
Descrição: XIX Simpósio Brasileiro de Química Teórica - SBQT 2017. Processo No.: 17614-2/2017 Natureza do projeto: Auxílio à Organização de Evento. Período: 12 a 17 de novembro de 2017. Fonte financiadora: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Coordenador. Financiador(es): Simpósio Brasileiro de Química Teórica - Auxílio financeiro.
Membro: Nelson Henrique Morgon.

2016

1.   2016-Atual. Compreensao do metabolismo de Saccharomyces cerevisiae durante fermentacao de acucares lignocelulosicos para producao de etanol de segunda geracao
Descrição: O projeto tem como principal objetivo a avaliação e a caracterização da cinética e do programa gênico (RNA e proteínas) da linhagem geneticamente modificada desencadeado ao longo da fermentação para compreensão de sua fisiologia.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante / Eliane Laranja Dias - Integrante / Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / Leandro Vieira dos Santos - Integrante / Osmar Vaz de Carvalho Netto - Coordenador / Inês Lunardi - Integrante / Luige Armando Llorena Calderón - Integrante / Beatriz Temer - Integrante / Guilherme Borelli - Integrante / Lucas Salera Parreiras - Integrante / PIROLLA, RENAN AUGUSTO SIQUEIRA - Integrante / Fabio Cezar Gozzo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / Osmar Vaz de Carvalho Netto - Coordenador.
Membro: Marcelo Falsarella Carazzolle.
2.   2016-Atual. Descoberta e desenvolvimento de novos compostos visando o controle de Moniliophthora perniciosa, causador da Vassoura-de-Bruxa do cacaueiro, com base na inibicao da respiracao celular. Tipo de
Descrição: O projeto tem como objetivo a descoberta e desenvolvimento direcionado de novos compostos com potencial antifúngico, baseados na inibição da respiração celular. Buscamos um inibidor ou inibidores específicos da AOX de M. perniciosa, bem como identificar novos mecanismos de resistência à inibição da respiração celular.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Eliane Laranja Dias - Integrante / Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / Gustavo Gilson Lacerda Costa - Integrante / Mário Ramos de Oliveira Barsottini - Integrante / Welbe Oliveira Bragança - Integrante / Rafael Victorio Carvalho Guido - Integrante / ZERI, ANA CAROLINA DE MATTOS - Integrante / Silvana Aparecida Rocco - Integrante / Artur Torres Cordeiro - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / Gonçalo A. G. Pereira - Coordenador.
Membro: Marcelo Falsarella Carazzolle.
3.   2016-Atual. Desenvolvimento de metodos high-throughput para o estudo de Quantitative Traits Loci relacionados a robustez de leveduras industriais (Saccharomyces cerevisiae)
Descrição: Tornar o estudo de mecanismos genéticos e a identificação de genes relacionados à robustez observada em linhagens industriais mais preciso, menos laborioso e com melhor relação custo-benefício. Com isso, pretende-se acelerar o desenvolvimento contínuo de linhagens mais produtivas, aplicadas à processos industriais que preveem o uso de matéria-prima renovável. Projeto associado ao Programas de Inovação Tecnológica / BIOEN - Programa de Pesquisa em Bioenergia. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante / Eliane Laranja Dias - Integrante / Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / Gleidson Silva Teixeira - Coordenador / Welbe Oliveira Bragança - Integrante / Sheila Tiemi Nagamatsu - Integrante / Alessandro Luis Venega Coradini - Integrante / Fellipe da Silveira Bezerra de Mello - Integrante / GALHARDO, JULIANA PIMENTEL - Integrante / Monique Furlan - Integrante / Carla Maneira da Silva - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / Gleidson Teixeira - Coordenador.
Membro: Marcelo Falsarella Carazzolle.
4.   2016-Atual. Desenvolvimento e aplicacao pratica de tecnicas de processamento, regularizacao e imageamento baseadas na tecnologia 3D HPC CRS no dominio pre-empilhado.
Descrição: O presente projeto tem como objetivo a generalização das técnicas de tipo Common Reflection Surface (CRS), desenvolvidas em projeto "Algoritmos de processamento e Imageamento Sísmico com Ênfase em Reservatórios Carbonáticos" no domínio pós-empilhado ou zero-offset (ZO), para o domínio pré-empilhado, bem como sua aplicação prática a diversos problemas importantes do imageamento sísmico. Tais problemas incluem a Regularização 5D, Migração CRP (Common Reflection Point) 3D, Tomografias NIP (Normal Incidence Point), IIP (Image Incident Point) e estereo-tomografia, bem como estudos sobre anisotropia. Além disso, essas técnicas serão desenvolvidas utilizando uma plataforma computacional (SeisHPC). Essa plataforma garante a escalabilidade do desempenho dos programas que a utilizarão, potencializando o uso intensivo de computação juntamente com técnicas de tolerância a falhas que permitem o processamento de dados sísmicos reais de grande porte (ordem de Terabytes). A vigência do projeto é de 3 anos a partir do seu início, em fevereiro de 2016.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Edson Borin - Integrante / Caian Benedicto - Integrante / Ian Rodrigues - Integrante / Jorge Faccipieri - Integrante / Martin Tygel - Coordenador / Tiago Antonio Alves Coimbra - Integrante / Danny Rueda - Integrante / Alcides Goldoni Junior - Integrante.
Membro: Edson Borin.
Descrição: O presente projeto tem como objetivo a generalização das técnicas de tipo Common Reflection Surface (CRS), desenvolvidas em projeto ?Algoritmos de processamento e Imageamento Sísmico com Ênfase em Reservatórios Carbonáticos? no domínio pós-empilhado ou zero-offset (ZO), para o domínio pré-empilhado, bem como sua aplicação prática a diversos problemas importantes do imageamento sísmico. Tais problemas incluem a Regularização 5D, Migração CRP (Common Reflection Point) 3D, Tomografias NIP (Normal Incidence Point), IIP (Image Incident Point) e estereotomografia, bem como estudos sobre anisotropia. Além disso, essas técnicas serão desenvolvidas utilizando uma plataforma computacional (SeisHPC). Essa plataforma garante a escalabilidade do desempenho dos programas que a utilizarão, potencializando o uso intensivo de computação juntamente com técnicas de tolerância a falhas que permitem o processamento de dados sísmicos reais de grande porte (ordem de Terabytes). A vigência do projeto é de 3 anos a partir do seu início, em fevereiro de 2016.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: Martin Tygel - Coordenador / Rueda, D. - Integrante / Faccipieri, J.H. - Integrante / COIMBRA, T.A. - Integrante / Ian Liu Rodrigues - Integrante / Caian Benedicto - Integrante / Edson Borin - Integrante / Alcides Goldoni Junior - Integrante / Edwin Huberto Fagua Duarte - Integrante.
Membro: Martin Tygel.
5.   2016-Atual. Ferramentas de biologia molecular para estudo da diversidade microbiana e caracterizacao de Staphylococcus aureus em laticinios organicos e convencionais no Estado de Sao Paulo
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Falsarella Carazzolle - Coordenador / Nathalia Cristina Cirone Silva - Integrante.
Membro: Marcelo Falsarella Carazzolle.
6.   2016-Atual. Otimizacao Topologica Evolucionaria para problemas Multifisicos e Multiescala.
Descrição: A modelagem e a síntese de sistemas físicos envolvendo a interação de fenômenos diversos que ocorrem em escalas de tempo e espaços distintas é um dos principais paradigmas atuais da engenharia mecânica. Com o objetivo de contribuir para o avanço das ferramentas de projeto usadas neste contexto, pretende-se neste projeto, desenvolver, implementar e validar metodologias para a otimização topológica evolucionária de sistemas multifísicos e multiescala usando-se técnicas computacionais eficientes. O método de otimização topológica evolucionária proposto envolve três etapas: obtenção da resposta do sistema, análise de sensibilidade e algoritmo de evolução. A etapa de análise do sistema é feita usando-se o método dos elementos finitos com formulações mistas acopladas. A análise de sensibilidade é feita usando-se métodos diretos e adjuntos. Na etapa de otimização serão propostos métodos heurísticos do tipo ESO/BESO (Evolutionary Structural Optimization/Bi-directional Evolutionary Structural Optimization). Dentre outros, serão estudados sistemas multifísicos do tipo: vibroacústica de sistemas periódicos, invisibilidade acústica, termomecânica com otimização multiobjetivo, poroelastoacústica envolvendo minimização da função de perda por transmissão e piezoeletricidade aplicada em sensores piezocompósitos. O problema de otimização envolve a minimização da resposta dos sistemas, que poderá ser o deslocamento, a pressão ou outra variável secundária. Para sistemas sujeitos a carregamentos estáticos, pretende-se ainda maximizar a rigidez estrutural do sistema para um dado volume final prescrito. Serão consideradas a otimização em múltiplas escalas, usando-se as teorias de materiais periódicos e de homogeneização. As aplicações para a ferramenta a ser desenvolvida são amplas e encontram-se em diversas áreas da engenharia, tais como, na redução de ruídos no interior de aeronaves e automóveis, no projeto de estruturas offshore, na melhoria de instrumentos musicais, no projeto de sensores e atuadores, no projeto de novos materiais, entre outras.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Renato Pavanello - Coordenador / William Martins Vicente - Integrante / Renato Picelli - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Renato Pavanello.
7.   2016-2017. Prospeccao de genes associados ao metabolismo de xilose em leveduras isoladas de insetos-praga e expressao funcional em linhagens industriais de Saccharomyces cerevisiae
Descrição: Visando à melhoria do processo fermentativo 2G, este projeto se insere no ambiente de busca por genes ainda desconhecidos de organismos nunca trabalhados para o definido fim. Tais genes apresentam um potencial de elucidar alguns detalhes ainda desconhecidos, como a porção da proteína que leva transportadores de açúcar se ligarem à xilose, além de encontrar genes candidatos para melhorar linhagens industriais para produção de etanol 2G, podendo tornar o processo economicamente viável.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Leandro Vieira dos Santos - Integrante / Guilherme Borelli - Integrante. Financiador(es): Universidade Estadual de Campinas - Auxílio financeiro.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
8.   2016-Atual. SeisHPC: Plataforma de desenvolvimento para aplicacoes sismicas e geofisicas de alto desempenho
Descrição: Atualmente na indústria de Óleo e Gás, diversos problemas reais de imageamento sísmico apresentam um grande desafio em comum, o uso intenso de recursos computacionais de alto desempenho. Entre os problemas mencionados podemos citar as técnicas de Regularização 5D e Migração CRP (Common Reflection Point) 3D. Estas técnicas têm como objetivo, construir imagens cada vez mais precisas do subsolo de maneira a encontrar recursos naturais localizados em regiões desafiadoras. O principal objetivo da plataforma SeisHPC é garantir a escalabilidade do desempenho dos programas que a utilizarão, potencializando o uso intensivo de computação nas CPUs e aceleradores (GPUs, Intel Xeon PHI, etc), juntamente com técnicas de tolerância a falhas visando diminuir significativamente o número de horas de processamento desperdiçados devido a diversos tipos falhas intermitentes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Edson Borin - Coordenador / Caian Benedicto - Integrante / Ian Rodrigues - Integrante / Martin Tygel - Integrante / Alcides Goldoni Junior - Integrante / Jorge Henrique Faccipieri Junior - Integrante / Dany Rueda Serrano - Integrante.
Membro: Edson Borin.

2015

1.   2015-2017. A Multicore Task Scheduler Platform (MTSP)
Descrição: Paralelização de trechos de programa que possuem dependências carregadas por laços ("loop-carried dependencies") é um problema complexo para o qual não existem boas soluções. Técnicas de paralelização baseadas em tarefas geradas dinamicamente a partir de um grafo de dependências vem sendo sugeridas como uma abordagem promissora para este problema, de maneira análoga ao que é feito pelo Algoritmo de Tomasulo durante a execução de instruções em processadores super-escalares. No entanto, o custo computacional de se manter dependências de tarefas é alto, e novos algoritmos e arquiteturas precisam ser estudados que minimizem este overhead. O objetivo final deste projeto é desenvolver algoritmos/arquiteturas de escalonamento de tarefas em uma plataforma experimental denominada Multicore Task Scheduler Platform (MTSP).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Guido Costa Souza de Araújo - Coordenador / Divino César Soares Lucas - Integrante / Lucas Henrique Morais - Integrante. Financiador(es): LG Electronics do Brasil - Auxílio financeiro.
Membro: Guido Costa Souza de Araujo.
2.   2015-Atual. Acordo de Cooperacao Tecnico e Cientifica SENAI/MS e UNICAMP
Descrição: O acordo tem por objetivo estabelecer uma parceria entre o SENAI/MS e a UNICAMP para a realização de atividades cooperativas técnicas e científicas, para difundir e promover, no âmbito acadêmico, a cooperação técnico-científica de projetos de interesse das instituições, para o desenvolvimento de trabalhos de pesquisa, ensino e extensão a serem realizados em parceria.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Jorge Lepikson Neto - Integrante / Marcela Mendes Salazar - Integrante.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
3.   2015-2018. Estudo da interacao entre farmacos e a albumina do soro humano (HSA) baseado em simulacao computacional, DFT e TDDFT, experimentos de dicroismo circular eletronico, ECD, e determinacao da constante de ligacao
Descrição: Pesquisador Associado do Projeto de Pesquisa: "Estudo da interação entre fármacos e a albumina do soro humano (HSA) baseado em simulação computacional, DFT e TDDFT, experimentos de dicroísmo circular eletrônico, ECD, e determinação da constante de ligação." Coordenador: Aguinaldo Robinson de Souza. Processo FAPESP 2015/22338-9. Natureza do projeto: Auxílio à Pesquisa. Período: 01/02/2016 a 31/01/2018. Fonte financiadora: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Integrante / Aguinaldo Robinson de Souza - Coordenador / Valdecir Farias Ximenes - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Nelson Henrique Morgon.
4.   2015-Atual. Exploracao de Paralelismo em Hardware e Software (PROCAD 2966/2014)
Descrição: A Lei de Moore, que prevê o dobro do número de transistores por circuito integrado a cada 2 anos, j a não pode ser aproveitada como no passado, inviabilizando o desenvolvimento de processadores maiores e com frequência sempre crescente. Desde o in ício deste século, por causa da barreira térmica, os fabricantes de processadores focaram seus esforços no desenvolvimento de arquiteturas multicore, evoluindo pouco na execução de código sequencial e forçando o desenvolvimento de versões paralelas de aplicativos. Embora este esforço esteja mostrando algum resultado, com a criação de novas versões de programas capazes de explorar o paralelismo dos processadores modernos, não há como negar que ainda existe muito trabalho a ser feito nesta direção e que nem todos os programas terão implementações paralelas eficientes. Por outro lado, qualquer nova técnica que melhore o desempenho de aplicações sequenciais também melhorará o desempenho de suas versões paralelas. O foco deste projeto é estudar técnicas de exploração de paralelismo, tanto em software quanto em hardware, permitindo a execução eficiente de programas em processadores modernos. Estamos interessados em melhorias arquiteturais, dentro dos cores, em novas formas de interligar estes cores, numa maior quantidade deles dentro de um circuito integrado, na utilização de aceleradores como GPGPU e em composições de múltiplos computadores na forma de clusters ou nuvem. Para cada uma destas configurações de hardware, também serão necessárias pesquisas e inovações na área de software. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Edson Borin - Integrante / Rodolfo Azevedo - Coordenador / Sandro Rigo - Integrante / Paulo Cesar Centoducatte - Integrante / Ricardo Ribeiro dos Santos - Integrante / Guido Araujo - Integrante / Alexandro José Baldassin - Integrante / Juliana Freitag Borin - Integrante / Ivan Rizzo Guilherme - Integrante / Renato Porfírio Ishii - Integrante / Fabricio Aparecido Breve - Integrante / Aparecido Nilceu Marana - Integrante / João Paulo Papa - Integrante / Mario Cortes - Integrante / Edson Norberto Caceres - Integrante / Nahri Balesdent Moreano - Integrante / Aleardo Manacero Junior - Integrante / Carlos Roberto Valencio - Integrante / Renata Spolon Lobato - Integrante / Roberta Spolon - Integrante.
Membro: Edson Borin.
5.   2015-2017. iMEanT: Methods for dealing with meanings and intentions on interactive collaborative systems (Pos-doutorado FAPESP)
Descrição: Web mediated communication and collaboration in many cases result in situations of misunderstanding and disagreement, which are due to design problems of mechanisms for sharing meanings and intentions. These issues create barriers for users easily reaching their goals and properly manage, retrieve and interpret available content. We aim at studying how people can express and recognize meanings and intentions, while interacting with web systems, by considering an underlying computer-interpretable representation model as support. Firstly, we propose to define a formal model, which accounts for the combined computational representation of meanings and intentions. Secondly, we propose to investigate methods to design appropriate interactive mechanisms for a smooth capture of people?s declared intentions. For this purpose, the project proposes experiments with groups of users to understand how they can comfortably express intentions on web-mediated systems. We aim to combine this empirical ground with a methodological and theoretical referential based on the Semiotics and Speech Acts theory to conceptualize our original approach and methods. We will carry out experimental validations to empirically assess the implemented prototypes in real application scenarios. Through this, we expect to achieve novel design techniques, interaction mechanisms and computational artifacts suited to enable users to express intentions during different moments of the interaction, without forcing people to comply with complex technology-oriented solutions. Our expected results might improve the effectiveness of collaborative web systems by considering semantic and pragmatic aspects.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Julio Cesar dos Reis - Integrante / BONACIN, R. - Integrante / BARANAUSKAS, M. CECILIA C. - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Julio Cesar dos Reis.
6.   2015-Atual. OpenMP para GPGPU: Transformacao e Otimizacao
Descrição: Um dos desafios mais importantes para os desenvolvedores de software modernos é a concepção de aplicações que tirem proveito do poder e benefícios de desempenho de arquiteturas heterogêneas. Estes sistemas contêm tipicamente um número de unidades de processamento, com diferentes características, que vão desde CPUs com múltiplos núcleos, GPUs altamente especializadas e aceleradores de hardware. Os telefones celulares, por exemplo, têm geralmente uma CPU para a execução das aplicações do usuário e sistema operacional, mas eles também contêm processadores especializados (por exemplo GPUs e DSPs) para melhorar o desempenho de tarefas de computação intensiva, como processamentos de áudio e vídeo. Este projeto visa o desenvolvimento de um framework de paralelização para sistemas heterogêneos baseados em GPU que irá permitir a síntese de código portátil padrão em representação intermediaria (SPIR) a partir de construções OpenMP.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Guido Costa Souza de Araújo - Coordenador / Marcio Pereira Machado - Integrante / Luís Mattos - Integrante / Rafael Cardoso Fernandes Sousa - Integrante. Financiador(es): Samsung Instituto de Desenvolvimento para a Informática da Amazônia - Auxílio financeiro.
Membro: Guido Costa Souza de Araujo.
7.   2015-2016. Quimica Teorica Supra e MacroMolecular: Estudo das Estruturas Eletronica e Molecular de Derivados do No Pentafoil (5\_1) e da Inclusao de Benzbromarona em beta-Ciclodextrina
Descrição: Hugo Penteado da Cunha. Química Teórica Supra e MacroMolecular: Estudo das Estruturas Eletrônica e Molecular de Derivados do Nó Pentafoil (5_1) e da Inclusão de Benzbromarona em beta-Ciclodextrina Processo No.: 161202/2015-2 Natureza do projeto: Iniciação Científica - IC. Período: 01/10/2015 a 30/09/2016. Fonte financiadora: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Coordenador / Hugo Penteado da Cunha - Integrante.
Membro: Nelson Henrique Morgon.
8.   2015-2018. Static analysis to detect energy bugs
Descrição: Energy bugs is a class of bugs that cause smartphones to waste energy. Pathak et al. [4] proposed a taxonomy to classify energy bugs and argue that 8% of the bugs are caused by "no­sleep" bugs on applications. A "no­sleep" bug is a software bug that causes smartphone components to stay on for an unnecessarily long period of time and is usually caused by the mishandling of power control APIs in an app or framework. The objective of this project is to investigate dataflow analysis techniques to detect energy bugs on applications for mobile devices.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Edson Borin - Coordenador / Sandro Rigo - Integrante / Vanderson Martins Do Rosario - Integrante / Maxiwell Garcia - Integrante / Alex Lucchesi - Integrante / Caio Salvador Rohwedder - Integrante / Luís Fernando Silva - Integrante.
Membro: Edson Borin.
9.   2015-2018. Technologies for smart interaction with Mods and IoT devices
Descrição: Advances in information technology, sensors, wireless communication and embedded processors are enabling the deployment of low cost and low power sensors and actuators that will connect our world in a way never seen before. Light bulbs, faucets, air-conditioning units, clothes, watches, smartphones, smart-meters, cars, public transportation, cloud servers and many other systems will be connected enabling a smarter use of our resources and a better/easier interaction with the environment around us. In this brave new world, known as Internet of Things, or IoT, billions of devices will be connected, sharing information that is constantly sensed from the environment and enabling near and remote monitoring and control of the environment. Many of the IoT devices will be attached to non-personal things, such as buildings and appliances, and will allow us to understand and improve how they are used. Even though these things are not personal, they will interact with smartphones, which are personal. We conjecture that by analysing this interaction we will be able to learn how smartphone users behave and help them to perform their daily activities by providing suggestions, reminders or even automating tasks on his/her behalf. Hence, the goal of this project is to explore how the interaction of the smartphone and other devices, such as IoT devices and Mods, can be used to improve the smartphone user experience.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . Integrantes: Edson Borin - Coordenador / Sandro Rigo - Integrante / João Batista Corrêa Gomes Moreira - Integrante / Juliana Freitag Borin - Integrante / Jeferson Brunetta - Integrante / Gustavo Pedrosa - Integrante / Felipe Lima - Integrante / Carolina Regattieri - Integrante / Luan Egidio Ferreira - Integrante / Benicio Goulard - Integrante / Diogo Shiraishi - Integrante / Felipe Emos - Integrante / Brenda Oliveira Ramires - Integrante / Matheus Silva - Integrante.
Membro: Edson Borin.

2014

1.   2014-2016. Algorithms and techniques to accelerate numerical simulation in the cloud
Descrição: Numerical computer simulation has become an important tool for the design of engineering products and services not only in the academia but also in high technology industries, such as aircraft, oil exploration, energy and others. In order to provide objective confidence levels in quantitative information obtained from numerical predictions it is important to account for the uncertainties related to the inputs of a computation attempting to represent a physical system. In this sense, stochastic analysis may be applied to measure the impact of the input parameters uncertainties on output data. However, this kind of analysis generally requires several hundreds or thousands of repeated simulations with a proper selection of the input values to provide reasonable confidence levels. These simulations, in turn, may consume a huge amount of computing power to be performed in a reasonable time frame. To acquire and manage a computing system with such computing power is not always feasible due to ownership cost and setup timing constraints. Moreover, the demand for resources when running simulation experiments generally varies with time leading to underutilization of the system when demand is low. Cloud computing, on the other hand, provides computing resources to consumers as a utility - consumers can access the IT resources easily and pay only for what they use. The goal of this project is to investigate algorithms and techniques for numerical computer simulation and stochastic analysis in the cloud.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Edson Borin - Integrante / Juliana Freitag Borin - Coordenador. Financiador(es): Microsoft Informática - Auxílio financeiro.
Membro: Edson Borin.
2.   2014-2018. ArchC 3.0 - Plataformas Embarcadas de Alto Desempenho e Baixo Consumo de Energia (Edital Universal 2014)
Descrição: A Lei de Moore, que prevê o dobro do número de transistores por circuito integrado a cada 2 anos, não é mais suficiente para fornecer o ganho de desempenho esperado das aplicações de uso geral. Desde o início deste século, os fabricantes de processadores direcionaram seus esforços ao desenvolvimento de arquiteturas multi-cores, forçando o desenvolvimento de versões paralelas de programas. Chegamos ao momento tecnológico onde o custo de um transistor é marginal e dispositivos móveis como celulares já possuem 4 ou mais \cores e começam a utilizar processadores especializados para gastarem menos energia conforme o momento de operação, como as arquiteturas big-little e a exploração de Dark-Silicon. A linguagem ArchC foi criada em 2002 e, desde então, tem sido utilizada em projetos de pesquisa e desenvolvimento em diversas instituições do Brasil e do mundo. Neste projeto pretendemos trabalhar com plataformas compostas por muitos \cores com objetivo de desempenho e foco em baixo consumo de energia como os encontrados em dispositivos móveis e ultra-low-power. Como resultado do projeto pretendemos ampliar a capacidade da linguagem na modelagem do consumo de energia do processador e também numa melhor aproximação do desempenho de execução quando se tratar de simulação multicores e manycores.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rodolfo Jardim de Azevedo - Coordenador / Paulo Cesar Centoducatte - Integrante / Sandro Rigo - Integrante / Edson Borin - Integrante / Mário Lúcio Côrtes - Integrante / Guido Araujo - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Rodolfo Jardim de Azevedo.
3.   2014-2015. Caracterizacao funcional de duas quitinases com possivel papel na patogenicidade de fungos sobre plantas de interesse economico
Descrição: O projeto teve por objetivo a avaliação funcional de duas quitinases potencialmente inativas, uma de Moniliophthora roreri, também patógeno do cacaueiro, e outra de Melampsora laricis-populina, fungo que ataca espécies de coníferas de importância econômica. A caracterização funcional dessas proteínas será realizada através de testes de atividade quitinolítica e experimentos para determinação da capacidade de ligação das proteínas à quitina. Ademais, serão conduzidos ensaios de alcalinização de suspensões de células vegetais, os quais permitirão avaliar se tais quitinases de fato bloqueiam a ativação da imunidade vegetal desencadeada pela quitina. A caracterização funcional destas quitinases, além de permitir a melhor compreensão das estratégias de evasão utilizadas por dois importantes fitopatógenos, possibilitará esclarecer se a inativação de quitinases pode de fato ser um mecanismo comum de origem de proteínas de virulência em fitopatógenos fúngicos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Gabriel Lorencini Fiorin - Integrante / ALIENDE PIRES, BÁRBARA - Integrante. Financiador(es): Universidade Estadual de Campinas - Auxílio financeiro.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
4.   2014-Atual. Computational Science and Engineering - FAPESP CEPID
Descrição: The Center for Computational Engineering Sciences (CCES) at the University of Campinas (UNICAMP) is an interdisciplinary research center established in June 2013 with the support from the State of São Paulo Research Foundation (FAPESP) under the CEPID Program. The Center is dedicated to the development and application of advanced computational modeling techniques to solve a variety of frontier problems in science and engineering that require high-performance and data-intensive computing. The CCES also aims to interact with industry and research institutions outside academia for technological innovation and to carry out outreach activities to promote science education and dissemination of knowledge in the broader area of eScience.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (20) / Doutorado: (30) . Integrantes: Claudia Maria Bauzer Medeiros - Integrante / Rodolfo Jardim de Azevedo - Integrante / Munir Skaf - Coordenador / Guido Costa Souza de Araujo - Integrante / Martin Tygel - Integrante / Euclides de Mesquita Neto - Integrante. Financiador(es): (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Claudia Maria Bauzer Medeiros.
5.   2014-2016. Convenio de cooperacao tecnico-cientifica entre a International Paper do Brasil, ArborGen Tecnologia Florestal e UNICAMP
Descrição: O objeto do Convênio consistiu no desenvolvimento de inovações das tecnologias em genômica aplicadas ao melhoramento genético do eucalipto para aplicação de base industrial das empresas IP e ArborGen, denominado Projeto EucaInova,. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (3) / Doutorado: (1) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Jorge Lepikson Neto - Integrante / Marcela Mendes Salazar - Integrante / Eduardo Leal Oliveira Camargo - Integrante / Rodrigo Adrian de Oliveira Abans - Integrante / Bianca Azevedo Curzio - Integrante / Mariana Teixeira Rebouças - Integrante. Financiador(es): ArborGen - Auxílio financeiro / International Paper do Brasil Ltda - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 5 / Número de orientações: 4
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
6.   2014-Atual. DeepEyes: Visual Computing and Machine Intelligence Techniques for Digital Forensics and Electronic Surveillance
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Edson Borin - Integrante / Ricardo da Silva Torres - Integrante / Eduardo Alves do Valle Junior - Integrante / Hélio Pedrini - Integrante / Siome Klein Goldenstein - Integrante / Anderson Rocha - Coordenador / Jacques Wainer - Integrante / William Robson Schwartz - Integrante / André Luiz da Costa Morisson - Integrante / Paulo Max Gil Innocencio Reis - Integrante / Jorge de Albuquerque Lambert - Integrante / Jefersson Alex dos Santos - Integrante / David Menotti Gomes - Integrante / CHIACHIA, G. - Integrante / Arnaldo Albuquerque de Araújo - Integrante / Nelson Luis Saldanha da Fonseca - Integrante / Flavio de Barros Vidal - Integrante / Dibio Leandro Borges - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Edson Borin.
7.   2014-2018. Estudo do transcriptoma e analise de fluxo metabolico (FBA) em levedura industrial para producao de bioetanol de segunda geracao
Descrição: Este projeto envolve o estudo do transcriptoma e análise de fluxo metabólico da levedura industrial Pedra-II da espécie Saccharomyces cerevisiae, geneticamente modificada para consumir xilose, através da comparação entre as fermentações de glicose e xilose como fontes de carbono.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Falsarella Carazzolle - Coordenador. Financiador(es): Universidade Estadual de Campinas - Auxílio financeiro.
Membro: Marcelo Falsarella Carazzolle.
8.   2014-Atual. Exploracao de Paralelismo em Hardware e Software
Descrição: A Lei de Moore, que prevê o dobro do número de transistores por circuito integrado a cada 2 anos, já não pode ser aproveitada como no passado, inviabilizando o desenvolvimento de processadores maiores e com frequência sempre crescente. Desde o início deste século, por causa da barreira térmica, os fabricantes de processadores focaram seus esforços no desenvolvimento de arquiteturas {\it multicore}, evoluindo pouco na execução de código sequencial e forçando o desenvolvimento de versões paralelas de aplicativos. Embora este esforço esteja mostrando algum resultado, com a criação de novas versões de programas capazes de explorar o paralelismo dos processadores modernos, não há como negar que ainda existe muito trabalho a ser feito nesta direção e que nem todos os programas terão implementações paralelas eficientes. Por outro lado, qualquer nova técnica que melhore o desempenho de aplicações sequenciais também melhorará o desempenho de suas versões paralelas. O foco deste projeto é estudar técnicas de exploração de paralelismo, tanto em software quanto em hardware, permitindo a execução eficiente de programas em processadores modernos. Estamos interessados em melhorias arquiteturais, dentro dos \textit{cores}, em novas formas de interligar estes \textit{cores}, numa maior quantidade deles dentro de um circuito integrado, na utilização de aceleradores como GPGPU e em composições de múltiplos computadores na forma de clusters ou nuvem. Para cada uma destas configurações de hardware, também serão necessárias pesquisas e inovações na área de software.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rodolfo Jardim de Azevedo - Coordenador / Paulo Cesar Centoducatte - Integrante / Sandro Rigo - Integrante / Edson Borin - Integrante / Nahri Balesdent Moreano - Integrante / Ricardo Ribeiro dos Santos - Integrante / Mário Lúcio Côrtes - Integrante / Guido Araujo - Integrante / Aleardo Manacero Júnior - Integrante / Alexandro José Baldassin - Integrante / Juliana Freitag Borin - Integrante / Renato Porfirio Ishil - Integrante / Edson Norberto Cáceres - Integrante / Roberta Spolon - Integrante / Renata Spolon Lobato - Integrante / João Paulo Papa - Integrante / Ivan Rizzo Guilherme - Integrante / Fabricio Aparecido Breve - Integrante / Carlos Roberto Valêncio - Integrante / Apareido Nilceu Marana - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Rodolfo Jardim de Azevedo.
9.   2014-2016. Influencia da biodegradacao de residuo solido urbano no recalque em lisimetros
Descrição: Este projeto visa estudar a influência da biodegradação de resíduos sólidos urbanos (RSU), oriundos do município de Campinas/SP, nos deslocamentos verticais, utilizando lisímetros de grandes dimensões.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante / Bruno Vaz de Oliveira - Integrante / Eglé Novaes Teixeira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
10.   2014-2017. Integracao de computacao heterogenea e computacao na nuvem para solucao de problemas de engenharia e ciencia
Descrição: A evolução das técnicas de simulação numérica permitiu a redução do tempo e do custo de ensaios experimentais utilizados para o desenvolvimento de técnicas e produtos em diversos segmentos da indústria. Este tipo de simulação envolve um grande número de cálculos e requer o uso de computadores de alto desempenho, o que torna seu uso restrito a grupos que possuam acesso a este tipo de sistema. O surgimento do modelo de computação na nuvem aliado ao desenvolvimento de aceleradores de baixo custo, como GPUs, disponibilizou um grande poder computacional para usuários que não possuem acesso a computadores de alto desempenho. Entretanto, a programação e aceleração de código nestes sistemas ainda é um desafio. Dessa forma, este projeto visa desenvolver diretrizes e técnicas para viabilizar a aceleração de simulações numéricas com recursos de nuvem computacional e aceleradores.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Edson Borin - Coordenador / Mauricio Breternitz Jr. - Integrante / Ricardo da Silva Torres - Integrante / Daniel Carlos Guimarães Pedronette - Integrante / Marco Lúcio Bittencourt - Integrante / Philippe Remy Bernard Devloo - Integrante / Sônia Maria Gomes - Integrante / Juliana Freitag Borin - Integrante.
Membro: Edson Borin.
11.   2014-Atual. Internacionalizacao e multidisciplinaridade nos cursos de engenharia: Sinergias e Duplos Diplomas.
Descrição: O objetivo global deste projeto é estabelecer laços sólidos e amplos de cooperação Internacional ao nível de ensino de graduação e o fomento das atividades de pesquisa realizadas entre a UNICAMP e o Grupo INSA da França. No Projeto BRAFITEC anterior, os departamentos de Engenharia Elétrica e de Computação foram privilegiados. O que se quer agora é reequilibrar os esforços, em especial com as Faculdades de Engenharia Mecânica, Civil Arquitetura e Urbanismo e Química da UNICAMP, Esta consolidação e ampliação da cooperação deverá visar a implementação de programas de duplo diploma nas diversas áreas envolvidas e incentivar a realização de trabalhos e estágios acadêmicos de fim de curso nos laboratórios de pesquisa das instituições parceiras.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (20) . Integrantes: Renato Pavanello - Coordenador / Jarir Mahfoud - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação.
Membro: Renato Pavanello.
12.   2014-2018. Quimica teorica supra e macromolecular: estudo das estruturas eletronicas e moleculares
Descrição: Processo No.: 306975/2013-0 Natureza do projeto: PQ - Produtividade em Pesquisa. Períodos: 01/03/2014 a 28/02/2018. Fonte financiadora: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Coordenador. Número de orientações: 1
Membro: Nelson Henrique Morgon.
13.   2014-Atual. Rede INTERSYS: Biologia Sistemica no Estudo de Funcao Genica em Interacoes Bioticas
Descrição: Estabelecer a rede INTERSYS, voltada para a formação de pessoal e geração de conhecimento científico de alto nível envolvendo interações bióticas a partir de abordagens multidisciplinares de biologia sistêmica (ômicas, biologia celular e bioinformática) através da integração de grupos nacionais e internacionais experientes. São 8 instituições brasileiras e 5 do exterior. Prof. Gonçalo atua como coordenador institucional pela UNICAMP.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante / Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / Luciana Mofatto - Integrante / Ana Maria Benko-Iseppon - Coordenador. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
Descrição: Estabelecer a rede INTERSYS, voltada para a formação de pessoal e geração de conhecimento científico de alto nível envolvendo interações bióticas a partir de abordagens multidisciplinares de biologia sistêmica (ômicas, biologia celular e bioinformática) através da integração de grupos nacionais e internacionais experientes. São 8 instituições brasileiras e 5 do exterior.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo Falsarella Carazzolle - Coordenador / Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães - Integrante / Luciana S. Mofatto - Integrante / Ana Maria Benko-Iseppon - Integrante.
Membro: Marcelo Falsarella Carazzolle.

2013

1.   2013-2015. Algoritmos e suporte em hardware para o projeto da maquina virtual Open-ISA VM
Descrição: Open-ISA é uma arquitetura de computador que está sendo desenvolvida no Laboratório de Sistemas de Computação da Unicamp como parte de uma estratégia para reduzir o déficit da balança comercial brasileira no setor de eletroeletrônicos. O seu desenvolvimento em conjunto com a máquina virtual Open-ISA VM permitirá que sistemas complexos, incluindo sistemas operacionais, ferramentas de produtividade e científicas sejam executados de forma transparente em diferentes arquiteturas, eliminando a vínculo do software nacional com as arquiteturas proprietárias de empresas estrangeiras. Este projeto visa investigar o estado da arte e propor novos algoritmos e suporte em hardware para implementar a máquina virtual Open-ISA VM de forma que as aplica- ções compiladas para Open-ISA possam ser emuladas de forma eficiente em arquiteturas atuais.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Edson Borin - Coordenador / Rodolfo Azevedo - Integrante / Sandro Rigo - Integrante / Guido Araujo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Edson Borin.
2.   2013-Atual. CECC - Centro de Engenharia e Ciencias Computacionais
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante / Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / Munir Salomão Skaf - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
Descrição: Propõe-se a criação de um centro multidisciplinar de alto nível, dedicado ao desenvolvimento e aplicação de métodos computacionais avançados e que venha solucionar problemas de fronteira nas ciências e engenharias, bem como promover avanços substantivos em inovação tecnológica e difusão desta área do conhecimento, a qual tem sido denominada e-Science. O "Centro de Engenharia e Ciências Computacionais" (CECC) deverá ser sediado na Universidade Estadual de Campinas em prédio próprio, que inclui um auditório para 160 pessoas, salas, e ambientes adequados para abrigar equipamentos computacionais, a ser construído com recursos provenientes de um projeto recém aprovado na chamada CT-Infra da FINEP, complementados por recursos da Universidade, totalizando R$ 6.634.400,00. O Centro congrega pesquisadores de elevado nível científico dos Institutos de Biologia, Computação, Física, Matemática, Química e Engenharia Mecânica da Unicamp, e tem a modelagem computacional de alto desempenho como agente unificador de sua temática e foco científicos. A proposta conta também com a participação de cinco pesquisadores de renome das Universidades do Texas e Yale, nos Estados Unidos, Universidade de Graz, na Áustria, e da Universidade de Buenos Aires, Argentina. O Centro constituirá um ambiente unificado de excelência, pioneiro no Brasil, visando multiplicar as competências atuais na área de simulação e modelagem computacional e a promoção efetiva da interação entre seus integrantes para a solução de novos desafios científicos em temas como nanomateriais, sistemas biomoleculares de interesse à saúde humana e bioenergia, bioinformática, sistemas particulados e semi-particulados, meios porosos, meios contínuos, e geofísica computacional, pelos quais permeia o desenvolvimento de técnicas avançadas de processamento paralelo e arquiteturas multi-core. O Centro deverá atuar estimulando e criando condições para a interação com setores produtivos. a geração de inovação e a difusão do conhecimento através de seus núcleos de Transferência e Inovação Tecnológica e de Difusão e Educação.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Doutorado: (20) . Integrantes: Renato Pavanello - Integrante / Euclides de Mesquita Neto - Integrante / Munir Salomao Skaf - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Renato Pavanello.
3.   2013-Atual. Center for Computation and Engineering Sciences
Descrição: Aprovado na proposta CEPID da FAPESP. We propose the creation of a world-class multidisciplinary Center dedicated to the develop- ment and application of advanced computational science for the following purposes: (a) To provide state-of-the- art facilities and highly qualified human resources devoted to face the present chal- lenges in high- performance and massive computation in science and engineering; (b) To promote substantial advancements in partnerships between academia and industry in Brazil and (c) To engage on science education and dissemination in these areas.. The Center will be housed in a fully equipped building that will provide working spaces to harbor faculty, researchers, students, visiting scholars, and technicians in order to boost cooperation and scientific interaction among its participants. Faculty will be drawn from various Departments at the University of Campinas, including Computer Science, Mechanical Engineering, Physics, Chemistry, Biology, and Applied Math. The primary goal of the Center is to bring together a team of scientists from the Uni- versity of Campinas, working in several scientific domains, with partners from abroad, to carry out high-level research in a cooperative manner, taking advantage of the fast growing area of high-performance and data-intensive computing.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rodolfo Jardim de Azevedo - Integrante / Munir Salomão Skaf - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Rodolfo Jardim de Azevedo.
4.   2013-Atual. Center for Computational Engineering and Sciences
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (15) . Integrantes: Vera Nisaka Solferini - Integrante / Munir Salomão Skaf - Coordenador.
Membro: Vera Nisaka Solferini.
Descrição: Proejto CEPID/FAPESP. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Doutorado: (40) . Integrantes: Munir Salomao Skaf - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Munir Salomao Skaf.
5.   2013-Atual. Centro de Engenharia e Ciencias Computacionais - CECC
Descrição: Programas de Inovação Tecnológica / CEPID da FAPESP. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alex Antonelli - Coordenador / Maurice de Koning - Integrante / Munir Salomão Skaff - Integrante / Douglas Soares Galvão - Integrante / Claudia Bauzer Medeiros - Integrante / Vera Solferini - Integrante. Financiador(es): Universidade Estadual de Campinas - Auxílio financeiro.
Membro: Alex Antonelli.
6.   2013-2018. Centro de Pesquisa, Inovacao e Difusao (CEPID) Centro de Engenharia e Ciencias Computacionais.
Descrição: Membro do Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPID) Centro de Engenharia e Ciências Computacionais - CECC (Center for Computational Engineering Sciences - CCES). Coordenador: Munir Salomão Skaf. Processo FAPESP 11/51348-1. Natureza do projeto: Programa de Inovação Tecnológica / CEPID - Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão / Edital 2011. Período: 01/05/2013 a 30/04/2018. Fonte financiadora: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Integrante / Munir Salomão Skaf - Coordenador / Rodolfo Jardim de Azevedo - Integrante / Vera Nisaka Solferini - Integrante / Douglas Soares Galvão - Integrante / Rogério Custodio - Integrante / Alex Antonelli - Integrante / Claudia Bauzer Medeiros - Integrante / Euclides de Mesquita Neto - Integrante / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante / Guido Costa Souza de Araújo - Integrante / Martin Tygel - Integrante / Renato Pavanello - Integrante / Daniel Laria - Integrante / Dario Estrin - Integrante / Guilherme Pimentel Telles - Integrante / Martin Schanz - Integrante / Maurice de Koning - Integrante / Peter Jacob Rossky - Integrante / Victor Salvador Batista - Integrante / Zanoni Dias - Integrante.
Membro: Nelson Henrique Morgon.
7.   2013-2016. Desenvolvimento direcionado de potenciais fungicidas baseados na inibicao da enzima oxidase alternativa para controle da doenca vassoura de bruxa do cacaueiro
Descrição: Este projeto envolveu o desenvolvimento, avaliação e identificação de novas moléculas bioativas com atividade inibitória frente à enzima oxidase alternativa (AOX) de Moniliophthora perniciosa visando à obtenção de novos candidatos a agentes antifúngicos para o controle da vassoura de bruxa.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Daniela Paula de Toledo Thomazella - Integrante / Gustavo Gilson Lacerda Costa - Integrante / Paulo José Pereira Lima Teixeira - Integrante / Osvaldo Reis Junior - Integrante / Paula Favoretti Vital do Prado - Integrante / Gabriel Lorencini Fiorin - Integrante / Rafael Victorio Carvalho Guido - Integrante / ZERI, ANA CAROLINA DE MATTOS - Integrante / Silvana Aparecida Rocco - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
8.   2013-2017. Matematica e Ciencias Sem Fronteiras na Educacao Basica - em Campinas e no Mundo
Descrição: O projeto será desenvolvido nas áreas de ciências e matemática em escolas públicas estaduais do ensino básico de Campinas, em caráter multidisciplinar e com a cooperação internacional com MESA - Mathematics, Engineering and Science Achievement (http://depts.washington.edu/mesaweb/). Estimular e reforçar o aprendizado dos conceitos de matemática e ciência na escola é um dos objetivos do projeto, de forma a manter abertas as oportunidades de carreiras nas áreas de Ciência, Tecnologia, Engenharia e Matemática (STEM em inglês) para estudantes de escolas públicas... Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (7) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (1) . Integrantes: Rodolfo Jardim de Azevedo - Coordenador / Tânia Alencar de Caldas - Integrante / Hudson Pacifico da Silva - Integrante / Elisabete Monteiro de Aguiar Pereira - Integrante / Vera Solferini - Integrante / Gustavo Pugliese - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Rodolfo Jardim de Azevedo.
9.   2013-2015. Modelagem de consumo de energia em dispositivos moveis baseados em processadores ARM
Descrição: O principal objetivo neste projeto é entender como a energia é consumida pelos componentes de hardware como CPU, GPU, memória, e dispositivos periféricos, levando em consideração todas as camadas da plataforma do software. Os resultados esperados incluem modelos de consumo de energia, uma metodologia eficiente para gerar estes modelos e medidas de consumo de energia para sistemas modernos baseados nos processadores ARM, considerando-se diferentes modos de consumo de energia do processador.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Edson Borin - Integrante / Sandro Rigo - Coordenador / Flávia Pisani - Integrante / Jeferson Brunetta - Integrante / Maxiwell Salvador Garcia - Integrante / João Henrique Stange Hoffmam - Integrante / Alexandre N. de Medeiros - Integrante. Financiador(es): Samsung Eletrônica da Amazônia - Auxílio financeiro.
Membro: Edson Borin.
10.   2013-2013. Participacao no XVII European Conference on Analytical Chemistry (EUROANALYSIS).
Descrição: Participação no XVII European Conference on Analytical Chemistry (EUROANALYSIS). Processo No.: 781/13. Natureza do projeto: Recursos para participação do Gabriel Heerdt. Período: 25/08/2013 a 29/08/2013. Fonte financiadora: Fundo de Apoio ao Ensino, à Pesquisa e à Extensão (Pró-Reitoria de Pesquisa) (FAEPEX-PRP/UNICAMP).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Coordenador / Gabriel Heerdt - Integrante.
Membro: Nelson Henrique Morgon.
11.   2013-2013. Participacao no XVII Simposio Brasileiro de Quimica Teorica (XVII SBQT)
Descrição: Processo No.: 1151/13. Natureza do projeto: Recursos para participação do Iran da Luz Sousa. Período: 24/11/2013 a 28/12/2013 Fonte financiadora: Fundo de Apoio ao Ensino, à Pesquisa e à Extensão (Pró-Reitoria de Pesquisa) (FAEPEX-PRP/UNICAMP).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Coordenador / Iran da Luz Sousa - Integrante. Número de orientações: 1
Membro: Nelson Henrique Morgon.
12.   2013-2016. Prospeccao de microrganismos fixadores de nitrogenio associados a cultura de cana energia e implementacao de um banco de microrganismos
Descrição: O projeto integra o edital RHAE/Pesquisador na empresa e tem por objetivo gerar um coquetel de microrganismos capazes de realizar a fixação de nitrogênio específica para a variedade de cana energia. Genes de interesse biotecnológico poderão ser identificados nos estudos de metagenômica e, através de manipulações genéticas em organismos industriais, estas características poderão futuramente ser utilizadas em diferentes processos de aplicação biotecnológica, gerando novas opções para conversão eficiente de substratos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Silvia Kazue Missawa - Integrante / Gleidson Silva Teixeira - Integrante / Eduardo Leal Oliveira Camargo - Integrante / Osmar Vaz de Carvalho Netto - Integrante / Luige Armando Llorena Calderón - Integrante / Giselle de Arruda Rodrigues - Integrante. Financiador(es): BioCelere Agroindustrial - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
13.   2013-2016. Quimica teorica supra e macromolecular: estudo das estruturas eletronica e molecular de derivados do no pentafoil (5_1) e da inclusao de benzbromarona em beta-ciclodextrina
Descrição: Processo No.: 472485/2013-0. Natureza do projeto: Apoio a Projetos de Pesquisa / Chamada Pública MCTI/CNPq No. 14/2013 - Universal. Períodos: 01/10/2013 a 30/09/2016. Fonte financiadora: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Coordenador / Gabriel Heerdt - Integrante / Iran da Luz Sousa - Integrante / Leonardo Viana das Chagas Lima - Integrante / Giordano Toscano Paganoto - Integrante.
Membro: Nelson Henrique Morgon.
14.   2013-2014. Utilizacao de Arabidopsis thaliana como ferramenta para estudo de genes candidatos ao melhoramento genetico de Eucalyptus
Descrição: Esse projeto contempla a ampliação dos protocolos e rotinas para a transformação genética e análise funcional de Arabidopsis thaliana. O uso de A. thaliana como modelo em estudos dos processos de formação da madeira é bastante comum, principalmente devido ao elevado tempo necessário para obtenção e desenvolvimento de espécies arbóreas transgênicas. No caso do Eucalyptus, espécie recalcitrante à transformação genética, a facilidade e rapidez da utilização da A. thaliana para estudos de genes responsáveis pela xilogênese torna essa técnica muito atraente e promissora.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Goncalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Jorge Lepikson Neto - Integrante / Marcela Mendes Salazar Mingireanov - Integrante. Financiador(es): Universidade Estadual de Campinas - Auxílio financeiro.
Membro: Goncalo Amarante Guimaraes Pereira.
15.   2013-2013. XII Encontro da SBPMat - Sociedade Brasileira de Pesquisa em Materiais.
Descrição: XII Encontro da SBPMat - Sociedade Brasileira de Pesquisa em Materiais. Processo No.: 2013/08252-9. Natureza do projeto: Organização do Simpósio G no XII Encontro da SBPMat. Período: 30/09/2013 a 03/10/2013. Fonte financiadora: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Nelson Henrique Morgon - Coordenador.
Membro: Nelson Henrique Morgon.


(*) Report production created from 2013 to 2019
Processing Date: 21/05/2019 03:00:16